У слова "маленький" буква "е", написание которой необходимо проверить, находится не в корне слова (корень - "мал"), а в суффиксе. Здесь необходимо запомнить правило: суффикс "иньк" употребляется только в трех словах - "заинька", "баиньки", "паинька". Так как слово "маленький" к таким словам не относится, то в данном слове будет суффикс "еньк", а правильное написание слова будет такое: "маленький".
